L'ENAM est dirigée par un Directeur général recruté conformément aux textes en vigueur et nommé par décret pris en Conseil des Ministres sur proposition du Ministre chargé de la fonction publique. La Direction générale de l'Ecole nationale d'administration et de magistrature comporte les structures suivantes: - un secrétariat général; - une direction de la formation initiale; - une direction de la recherche appliquée et des publications; - une direction de la formation continue; - une direction de l'administration e.t des finances; , - une direction de la formation des personnels des collectivités territoriales; - une direction des ressources humaines; - une agence comptable; - une personne responsable des marchés publics - les instituts régionaux d'administration; - des organes spécialisés ; - un contrôlé interne.